Acesse Financeiro > Contas a Pagar clique no botão de Outros Cadastros > Despesas Fixas, depois basta clicar no ícone excluir em formato de lixeira na coluna Ações da despesa fixa desejada.

As despesas em aberto dessa despesa fixa serão excluídas e não terão mais o vínculo com a antiga despesa fixa.