Primeiramente cadastre uma nova configuração de boleto do seu banco. Para saber como veja essa resposta da nossa base de conhecimento: Como cadastrar/configurar uma configuração de boleto?
Dica: Ao cadastrar as novas configurações veja as informações cadastradas na outra configuração e tente copiá-las como os dias para crédito, dias para débito da tarifa bancária, agência, conta, convênio (se houver) e cedente (se houver). Basicamente a única informação que vai ficar diferente é a carteira pois é a forma do banco saber que agora os títulos são registrados.
Após cadastrar e configurar o novo boleto é necessário que você "migre" seus clientes para a nova configuração de boleto e assim os próximos boletos sejam gerados com registro. Para saber como aplicar essa nova configuração acesse essa resposta em nossa base de conhecimento: Como aplicar uma configuração de boleto para meus clientes?
Para saber dos cuidados sobre a carteira com registro e o que muda com a carteira com registro, acesse essa resposta em nossa base de conhecimento: Quais os cuidados preciso ter em relação aos boletos com registro?