Para gerar uma cobrança avulsa com um valor diferente do somatório das vendas, é necessário alterar o valor de umas das vendas acessando Venda > Listar Vendas.
Para saber como editar o valor de uma venda acesse Como editar o valor de uma venda?
Ao acessar novamente a tela de cobrança avulsa com o valor de uma venda alterada, o valor ficará de acordo com o desejado.