O Conexa enviará automaticamente a nota fiscal para o cliente quando a opção "Enviar e-mail de nota fiscal para o cliente após a emissão" estiver habilitada, você pode habilitar ou desabilitar a opção através do seguinte caminho:

Configurações > Unidade > Editar

Aba Nota Fiscal

E marca para habilitar

Com essa opção habilitada, o sistema irá realizar o envio independente se a nota foi emitida na GERAÇÃO, na QUITAÇÃO da cobrança ou MANUALMENTE.
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O envio da nota fiscal poderá ser realizado também através do Aviso, do Histórico de Notas Fiscais, da Visualização da Nota Fiscal ou na própria cobrança em Contas a Receber. Abaixo mostraremos como fazer esse procedimento em cada uma das opções supracitadas.
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Para enviar através de um Aviso, basta enviar um aviso normalmente. Para mais informações de como enviar um aviso manual, acesse essa resposta de nossa base de conhecimento: Vídeo - Como enviar cobranças por email para meus clientes? Como configurar o módulo de envio de cobrança automática?
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Configurando o aviso, basta certificar-se de que o modelo de aviso utilizado tenha o parâmetro [linknotafiscal] no corpo do modelo. Esse parâmetro será substituído pelo link da(s) nota(s) fiscal(is) referente a essa cobrança.
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Para envio manual do e-mail com a nota fiscal, basta verificar a coluna NFSe (de uma cobrança com nota emitida) e clicando no ícone da folha de papel, aparecerá as opções disponíveis para a nota fiscal, sendo uma delas o "Enviar a Nota Fiscal Por E-mail".

Clica no ícone de nota fiscal

E clica para enviar