Acesse Config > Serviços/Itens > Salas clicando no botão de edição na coluna Ações respectivo a sala que deseja alterar.

Procure e marque a opção Permitir fracionamento do valor da reserva por cada minuto utilizado na parte de configurações.

Depois da habilitar essa função basta acessar a tela inicial e alterar os horários selecionando a hora exata de saída e/ou entrada do cliente ou fazer uma nova reserva através do formulário de reserva rápida.

Por padrão o valor da reserva será alterado proporcionalmente ao valor da hora. O valor da reserva pode ser alterado manualmente acessando Reserva > Listar Reservas e edite a reserva desejada informando o valor a ser realmente cobrado.