Alguns passos são necessários para que seja feita essa retificação:
Boletos Gerencianet
A partir de agora não é necessário primeiramente cancelar a transação no Gerencianet para cancelar ou excluir uma cobrança no Conexa. O processo é feito automaticamente, ao cancelar/excluir uma cobrança no Conexa, a transação será excluída/cancelada automaticamente no Gerencianet.
Boletos Bancários
1 - Exclua o Boleto no banco;
2 - Exclua a cobrança no Conexa, mas antes verifique se há nota vinculada a cobrança caso sim, cancele a nota primeiro;
3 - Vá em Vendas > Listar Vendas e cancele a venda que deseja. Se for uma venda de contrato, marque a opção Exibir Vendas Originadas de Contrato, se for o caso você também pode conceder desconto na venda clicando no ícone da Calculadora.
4 - Fature novamente o cliente acessando Financeiro > Faturar > Cobrança Contratual e Utilize a opção Faturar Apenas um Cliente. Nessa tela você também pode conceder desconto na cobrança que será gerada.
5 - Gere novamente o arquivo de remessa e envie ao banco;
Para saber mais sobre como excluir/cancelar uma cobrança, acesse: Como excluir uma cobrança?