Caso você tenha vinculado uma conta no meio de recebimento, no momento da configuração do boleto e tenha a necessidade de alterar a conta, você consegue seguindo o passo a passo abaixo.
​
Acesse Config (engrenagens) > Financeiro > Boletos clique nos três pontinhos na coluna ações para que a opção de EDITAR seja exibida. Na tela que será exibida, altere a conta a que o boleto está vinculado:

Caso você use o Gerencianet acesse config (engrenagens) > unidades, clique nos três pontinhos (...) na coluna ações para que a opção de EDITAR seja exibida, na tela que irá aparecer selecione a aba Gerencianet, as configurações desse meio de recebimento serão exibidas, mais um vez busque o campo CONTA e edite para a conta desejada.