Atualmente, não há uma opção no sistema para separar as unidades. Uma opção, é desativar essa subunidade do sistema matriz e contratar uma instalação nova, do zero.

Para desativar, envie um e-mail para [email protected], com cópia para [email protected], fazendo essa solicitação.

Feito isso, pode ser realizada a importação de dados da unidade cancelada para o novo sistema, para que você não precise cadastrar tudo de novo manualmente.

Nesse momento, fazemos apenas Importação de Clientes, Fornecedores e Pessoas.
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Você pode exportar os dados indo no sistema Conexa, na aba lateral em cliente/pessoas, filtrar pela unidade desativada, e em seguida selecionar todos e clicar no botão Excel:
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Com isso você terá dados importantes que podem servir para importação no novo sistema.

Temos um artigo prontinho com todos os detalhes de como fazer a importação, basta clicar no botão abaixo.