No Conexa, ao excluir um faturamento, a nota fiscal não é automaticamente cancelada, então é preciso se atentar a configuração do cliente, para que não ocorra a duplicação de notas para o mesmo serviço prestado

Para conferir a configuração do cliente você vai no dashboard do cliente e na aba de configurações, onde você terá o campo Emissão da Nota fiscal

É preciso se atentar caso esteja configurado para Emitir na geração ou na quitação da cobrança

Se você quiser utilizar a mesma NF nesse novo faturamento, selecione a opção Não emitir automaticamente, salva e aí pode faturar de novo, que não será emitido uma nota fiscal para essa nova cobrança

Você encontra todas as notas fiscais emitidas no sistema, através do seguinte caminho Relatórios > Contas a receber > Notas fiscais > Histórico de notas fiscais

Nessa aba, você pode baixar a nota fiscal

E também pode salvar na aba de anexos do cliente, para uma consulta mais fácil