Para realizar essa ação precisa acessar o seguinte passo a passo:

Configurações > Configurações Gerais:

E no campo Configurações de Contrato você pode marcar ou desmarcar uma das opções de cálculo de Pró-rata:

Caso o contrato já esteja cadastrado, será necessário excluí-lo e recadastrá-lo novamente. Assim o valor da primeira mensalidade será recalculado.

Caso contrário, basta cadastrar o novo contrato para que a nova configuração seja utilizada pelo sistema.