Você consegue desvincular uma reserva do pacote de horas caso queira cobrá-la apenas se a reserva não estiver faturada, você pode ir em Venda > Pacote de Horas clique no ícone na coluna de "Utilizações", e na coluna de ações clicando nos 3 potinhos (...) e na opção "Desfazer Desconto", observe a imagem abaixo:

Assim essa reserva ficará passível de cobrança, e você pode gerar a cobrança indo em Financeiro > Faturar > Cobrança Avulsa e poderá selecionar a Venda que deseja faturar.