IMPORTANTE: Caso a cobrança em questão tenha sido faturada antes da ativação da retenção no cadastro do cliente, será necessário excluí-la e faturar novamente. Apenas dessa forma o sistema conseguirá reter.
Para habilitar essa opção você deve ir no Dashboard do Cliente > Editar Cliente:
Clique em NFSe depois marque a opção de reter iss:
Após marcar essa opção, pode clicar em Salvar Cliente.