Para excluir uma despesa basta seguir esse caminho:
Acesse Financeiro > Contas a pagar
Você pode inserir diversos filtros para encontrar as despesas desejadas, filtros por data de quitação, débito, vencimento, filtrar por categorias e subcategorias de despesas:
Caso a despesa esteja quitada é necessário reabrir antes, Ações (...) > Reabrir
E então pode excluir a despesa, Ações (...) > Excluir
Você também pode realizar em lote: selecione as despesas que deseja excluir e no botão de Ações em Lote clique na opção de Apagar Selecionadas logo acima da tabela de listagem das despesas.
ATENÇÃO: Antes de excluir as despesas verifique a necessidade e os motivos para evitar problemas futuros.